De kvartærzoologiske samlinger omfatter arkæologiske og geologiske skeletrester af dyr fra Kvartærperioden (de seneste 2,6 millioner år). Hovedfokus er på faunarester fra Danmark og Grønland, men på grund af historiske indsamlinger, er der også solide sydamerikanske samlinger og i nogen grad fra det vestlige Asien og Sydøstasien.